北段自鎮江至望亭，地勢自西北向東南傾斜，其中鎮江至丹陽，地勢最為高亢，多岡隴地區。運河水在這壹段的流向亦以丹陽為分界。整個河段，壹般汛期有江水內灌，以利舟航；冬春枯水時，長江水位低落，常患水量不足。
為了節制水流，維持運道水深，以利轉漕，歷史上曾在這壹河段的南北兩端設堰(埭)閘，控制水量。堰閘的始創時期，文獻記載不詳，但鎮江城南的丁卯埭，至遲在晉代已經設置。到宋淳化(990)以前，這壹河段運河上已設有京口、呂城、奔牛、望亭等4堰，分級蓄水，維持通航。
這些堰閘，唐宋以來，各代均有興修，或改堰為閘，或廢閘復堰，至清末才逐漸毀壞。上述堰閘中，特別由於鎮江附近長江主泓道的變遷，運河人江口門經常受到江潮挾帶泥沙淤塞的威脅，因此運河的入江口門不得不經常變動。
在歷史上，鎮江附近運河入江口***開鑿有5個，即丹徒口、諫壁口、甘露口、小京口和大京口①。隋代以前，運河的入江口在丹徒，對面濱江的為今揚州揚子橋，江面闊40裏。後來由於揚子橋以南的江面積沙為洲，因其形狀如瓜，稱為瓜洲。
唐開元以後，沙洲面積日廣，民居其上，漸為大江南北交通襟喉，這時江面已束狹為20余裏。開元二十五年(737)時，齊瀚遷潤州刺史，以“州北隔江，舟行繞瓜步，回遠六十裏，多風濤”②，便奏請於京口埭下直趨渡江20裏，開伊婁河於揚州南瓜洲浦，長25裏，即達揚子鎮，並立伊婁埭，官收其入，亦曰伊婁堰。
說明開元後因揚州壹側江濱沙洲的淤積，並與北岸連成壹體，為減少漕船在江中迂回航行的風濤之險，運河在鎮江的入江口門已從丹徒口移至京口埭下。宋時，瓜洲渡口江面猶18裏。清道光初年(1820年前後)，江寬僅七八裏，當時江岸直逼鎮江蒜山、北固山、象山腳下，金山、焦山均為江中孤島。但隨著長江主泓道的逐漸北徙，明末清初，瓜洲壹帶江岸已開始受沖。
據《瓜洲續誌》記載，到道光十年(1830)以後，瓜洲城“逐年愈坍愈甚”，至光緒元年(1875)瓜洲全城淪人大江，居民移居舊城以北的四裏埠，這就是今天