矽化木的石化是對原組織分解的礦物質進行置換的過程，通常指的是矽或鈣。在壓力和溫度的雙重作用下，矽與其分解的雜質結合再次結晶，通常會導致新礦物形態的出現。矽的重結晶會破壞木材的結構。
矽化木的礦物成分主要是應時(主要為隱晶質或細粒應時)和應時變種，蛋白石、瑪瑙、玉髓以及少量的方解石、白雲石、褐鐵礦、磁鐵礦、赤鐵礦、菱鐵礦、輝石和碳。在不同類型的矽化木中，主要礦物含量變化很大，但應時在90%以上。
矽化木在古拙因其質地細膩、堅硬、色彩豐富、線條清晰、典雅、滄桑、堅固，是制作巖石盆景、裝飾工藝品、首飾的絕佳材料。
矽化木的清潔與維護
清潔矽化木時，請選擇溫和的清潔劑或天然清潔劑。溫和的洗手液和蘋果醋是清潔矽化木的好選擇。如果木材定期清洗，不是很臟，只能用溫水。矽化木用的產品越少越好。極少數情況下，汙漬較深時，壹般pH值為中性的清潔劑適用於矽化木。
矽化木應該用軟布清潔。軟針織布或超細纖維布是處理石化木材的最佳選擇。遠離任何比這更粗糙的墊子，以保護木材。