清末大量新式學堂的創立，使得原有的以科舉和經學選賢任能為中心的古代學術框架無法適應，新的學術體系的建立被提上日程。1902年8月5日，由管理部部長張百熙制定的《欽定學堂章程》正式出版。它是中國近代頒布的第壹個學制文件，被稱為“任印學制”。這個學制雖然公布了，但並沒有實行，成為新學制的先行者。
1903年，張之洞奉命入京，主持制定新學制。1904 1月，清廷批準了《奏校章程》，稱為“癸卯學制”。這是我國教育史上第壹個正式頒布的學制，並在全國廣泛推行。它的頒布結束了中國幾千年來無章程辦學、無制度辦學的狀態，確立了中國現代學術制度的基本模式和框架，奠定了中國現代學術制度的第壹塊基石。學制壹直延續到1911年清朝滅亡。
《癸卯學制》包括學制大綱、學校管理通則、考試條例、獎勵條例、各級學校章程等22條。對各類學校，從蒙古敬老院到儒家學校，從普通教育、師範教育到實業教育，從教師的任用到學校的管理，從辦學宗旨、培養目標、招生規則、學習年限、課程設置、教學方法、儀器設備、校舍到考試和獎勵，都作了詳細的規定。
這個學制基本是模仿日本的。縱向分為三段七級，即初等教育段(托兒所、小學堂、高等小學堂)、中等教育段(中學)、高等教育段(高等學校或大學預科、分校、儒家學校)。規定小學堂5年，高等小學堂5年，中學堂5年，高等學校(大學預科)3年，大學堂3-4年；也就是從小學到大學畢業大概需要22年。此外還有最高級別的儒家學派，學制五年。在橫向方面，中學分為普通學校、工業學校和師範學校。除了分校，還有優秀的師範學校和高等工業學校。其他屬於高等教育性質的機構有外國語學院、方言學院、進士學院和官修學院。由此，它構成了壹個三縱三橫的整體結構。
“桂茂學制”體現了“中體西用”的原則，強調以儒家倫理道德培養學生品格，以西學技能為輔，嚴格紀律和管理。課程體系在德育方面非常突出。修養被列為中小學課程之首，並開設專門的講座課程。但各個學校的培養目標和人才規格不同，突破了傳統教育培養官僚精英的單壹目標。《曲定學堂章程》中關於蒙古敬老院的規定，是我國幼兒教育制度正式建立的開端。小學和中學分為官、公、私三種，這也打破了儒家經典在教學內容上壹統天下的局面。以中學為例，其學習科目包括:修身養性、經典閱讀與講學、漢字、外語(日語、英語或德語、法語和俄語)、歷史、地理、數學、博物學、理化、法制與財務管理、制圖、體操等。課程12，每周36點上課，每周9點經典閱讀和講座。“桂茂學制”建立了單獨的師範教育體系，分為初等師範學校和優秀師範學校兩個層次，並規定師範生不交學費，從而吸引了許多貧困家庭的孩子入學。此外，還建立了工業教育體系。工業學校分為五類:工業教師工場、農業學校、工業學校、商業學校和商人學校，每個工業學校又分為高級、中級和初級三個級別。
音樂學院的章程規定大學堂的目的是遵守法令，糾正潮流，培養通才。大學禮堂對於任命具有各種學術和藝術能力的人才是有效的。“規定大學堂分八科，經學列為小組學之首，這是壹種妥協。但它畢竟打破了傳統的經學、史學、諸子學、詞章構成的“四部學”的學術格局，奠定了現代學術的分科基礎。民國成立後，大學分為文、理、法、商、醫、農、工七科，從而完成了從傳統的“四部學”到現代“七部學”的轉變。
1905 12、清政府建立教育部，這是中國歷史上第壹次建立正式的、獨立的、專門的中央教育行政機構。此前，清朝的教育行政是圍繞科舉考試展開的，並不直接面對各類學校。國家壹級的教育管理職能屬於國子監和禮部。國子監不僅是中國最高學府，還負責管理中央官學，而禮部則負責管理各地的教育事務。兩個部門權限重疊，不能納入；翻譯、船政、水陸軍校等新式學堂分屬各系，不由禮部和國子監管理。新舊學校與舊衙門並存。學部的建立經歷了十年左右的艱難時期。學者認為，“關鍵是學部的設立會動搖禮部等舊機構的地位，觸及傳統政治文化的核心”。學部的設立突破了中央行政體制改革的瓶頸，並於次年成功實施了清政府中央官制的全面改革。此後，各省都設立了勸學部，各部、縣、郡都設立了勸學學校，從而建立了從中央到地方統壹的教育行政體系。
科舉制度的終結壹波三折，從戊戌變法時提出改科舉，到真正廢除科舉，歷時七年。1901年，湖廣總督張之洞、兩江總督劉坤壹奏“優先議變通政才”，稱“儲江可奏”，並提出四項重要任務:設文武學堂、隨意改文科、停武、賞遊學，但在是否廢除科舉問題上措辭模糊。戊戌變法後，清廷第二次明確廢除八股，改變策略，停武。1904年，張百熙、榮慶、張之洞等人建議修改科舉，將科舉考試的考生人數減少到由學校學生補充，得到清廷的批準。此後日俄戰爭爆發，立憲呼聲高漲，革命迫在眉睫。1905年9月2日袁世凱、趙爾勛、張之洞等。出版《請廢除科舉》壹書，要求他們立即停止科舉以廣開學派，提出廢除科舉的主張。面對危機，嚴清當天科舉考試正式暫停。光緒皇帝下了壹道命令:“從C-5科開始，停止壹切鄉考，停止壹切省考。”隋朝以來，實行了1300多年的科舉制度終於走到了盡頭。
科舉制度的大刀闊斧廢除，既表明了革故鼎新的態度，也是壹個自然的過程。這時，癸卯學制已經頒布，史靜大學堂也已經開始，壹個新的教育體系的框架已經形成。然而，這場“不流血的革命”對社會制度造成了全方位的沖擊，對中國的社會現代化產生了復雜的影響。只有在未來，人們才會有越來越深刻的理解。
中國的教育現代化自上世紀之交至今已有壹百年。當前，中國社會正處於壹個新的巨大變革之中。教育不僅成為重中之重，也再次成為眾矢之的。我們需要認真回顧中國教育現代化的百年歷程，深刻反思中國教育改革的經驗教訓，進壹步認識教育在社會現代化進程中的特殊作用，確定新世紀我國教育改革的價值、目標和任務。