第1集乾隆二十五年。阿裏和卓準備帶著他們的女兒和龐大的回民隊伍去北京。在路上，他們被壹把血淋淋的刀搶劫了。在北京，燕子、魏紫等人正在粉刷壹家嶄新的餐廳，他們粗心大意！他們用油漆濺了滿身，同時又突然聽說太後要回宮了，慌了手腳，辭職了！鄭曉燕和魏紫沒來得及洗掉臉上的油漆，就匆匆去見司機了。然而，燕子和魏紫的尷尬給太後留下了深刻而不愉快的印象。
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珍珠公主2多樣性第2集小燕子和其他回民嘉賓真的很陌生。最後，燕子仰慕回民戰士蒙丹的高超武功，萌生了向蒙丹學習的念頭，並囑咐劉清的兄弟姐妹好好照顧身受重傷的蒙丹。燕子和魏紫因為出宮耽誤了太後的晚宴，所以呼籲嚴厲斥責。燕子急中生智，輕松逃脫。阿裏和卓，帶著公主等隊伍，陸續抵京。在城市的街道上，到處都擠滿了圍觀的人們，而蒙丹等人則用銳利的目光註視著遊行隊伍。
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還珠格格2分集劇情第3集宮中鼓樂奏響，甘龍打開宮門，迎接千裏迢迢回新疆的阿裏合卓和他的女兒帶著芬芳入宮。在皇宮的大舞臺上，韓翔還用獨特的回族舞蹈獻給了甘龍，但甘龍對韓翔的魅力壹見鐘情。燕子敢頂撞壹國之君，是因為不忍看她失寵。盛怒之下，乾隆打了鄭曉燕壹耳光。燕子和魏紫對壹向和善的乾隆感到失望。燕子更加生氣，揚言要離開皇宮和永琪。頓時，所有人都騷動起來。
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珍珠公主2多樣性第4集燕子和魏紫對他們深愛的乾隆失望了。燕子更是怒不可遏，揚言要離開皇宮和永琪。頓時，大家都陷入了迷茫的狀態。甘龍到漱芳齋安撫燕子和魏紫的情緒後，父子倆和好如初。不久，乾隆冊封韓翔公主為“費翔”。
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朱桓公主2分集第5集甘龍特爾康和雍琪護送費翔進城送別阿裏和卓，可就在大家都想回宮的時候，帶著幾個黑毛巾的蒙面武士打了起來，準備搶劫，於是爾康和雍琪又和等人打了起來，雙方展開了戰鬥！燕子和魏紫同情費翔的遭遇，所以他們很俠義，想幫助費翔和蒙丹這對苦命的戀人，但兩個格格卻陷入了另壹場危機。
第六集，暗室裏燕子和紫薇的狀態不明，差點害死爾康和永琪。好在才貌雙全的晴兒機智的解決了燕子和紫薇的危險，但是聰明的晴兒卻成了紫薇最大的威脅。燕子、魏紫和費翔因種種難忘的經歷而變得更加親密和堅強，費翔也因知己而漸漸露出喜悅之情。此時十五弟出世，宮中壹片歡騰。然而，皇後和榮嬤嬤卻掩飾不住對公主和費翔的寵愛，心中燃起了嫉妒和不甘。
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《還珠格格2》第7集燕子和扮成太監出宮，因為他們要替項公主向報信。聽了和項公主感人的愛情故事後，他們制定了壹個大計劃。那天小燕子等人得知了行程，然後就是壹陣懲罰。太後這次連舒芳齋的家奴都沒放過，全都被打得很慘！燕子和魏紫無法掩飾他們的奴隸受到傷害，所以他們站出來保護他們。但皇後趁機火上澆油，讓太後用嚴刑峻法。結果在舒芳齋，全家都成了慘不忍睹的傷兵，而他們這次的救星就是聰明善良的清格格。
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《朱桓公主2》第八集有太後，漱芳齋有很多危機。即使是乾隆皇帝也未能實現他對燕子和魏紫結婚的承諾，這意味著燕子應該多讀書，以取悅太後。永琪給燕子編了壹套“成語”，但是燕子把成語讀得很可笑，大家都很擔心燕子的學習。然而，被乾隆特許的費翔並不需要滿族服飾，而是學會了滿族規矩。然而，在太後和皇後的威脅下，她忍辱負重地被剝光了衣服。費翔盡力反抗，但她變得暴力了。
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格格公主第二集第九集項受不了眾人的侵辱，跳樓自殺。幸運的是，燕子獻出了她的生命來救她，但甘龍非常生氣！於是皇後和所有的護士都被訓斥了壹頓，但是皇後不願意處理小燕子等人，更加堅決。乾隆皇帝多次暗示爾康、魏紫、永琪、小燕的婚姻危機。這時，受到桑妮威脅的魏紫終於將她的疑慮化為淚水，崩潰了。魏紫和爾康也在壹場混亂中產生了嚴重的誤會，他們的海誓山盟也泛起了漣漪。
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朱桓公主2第10集在惠賓樓。魏紫和爾康仍然情緒低落。魏紫借酒消愁，小燕子也很樂意喝酒。然而，魏紫的魅力卻引起了鄰桌客人的註意。爾康壹時受不了客人的無禮，便和會賓樓的所有人打起架來。喝醉的魏紫和燕子又被太後抓住了，但兩個格格都醉得不省人事，在慈寧宮的浴室裏大吵大鬧。他們誤將皇後、榮嬤嬤等人打得落花流水，最後落得個黑屋子，晴兒此時又來幫忙。
在第11集裏，魏紫和爾康經過痛苦的折磨，終於克服了誤會。費翔在禦花園展示了她不同尋常的身體。她輕盈地起舞，身上的香氣四溢。然後壹群蝴蝶圍著費翔、燕子和魏紫跳舞。這壹美景震撼了皇宮，乾隆更加喜愛費翔。因為燕子想像芬芳的公主壹樣吸引蝴蝶，所以她命令所有的奴隸壹起收集花瓣，在花瓣浴中浸泡壹整夜。她希望這能讓花兒粘在她身上，吸引蝴蝶。然而，燕子吸引不了蝴蝶，卻引來了成群的蜜蜂，蜇了她的頭。
回溯:/插曲/還珠格格250/2/
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珍珠公主2分集第12集皇後得知小燕子被蜜蜂蟄了，特地來漱芳齋看笑話。小燕子不甘心，就聰明地把花瓣塞進了皇後的帽子裏。結果，當皇後來到禦花園時，壹群蜜蜂又襲擊了皇後和榮嬤嬤。當她看到王後時，嚇得臉色發白，而小燕子和其他人卻笑得歇斯底裏。爾康、魏紫等人精心策劃了壹場為皇帝慶生的精彩節目，讓乾隆大吃壹驚。然而，就在大家沈浸在生日快樂的時候，卻在漱芳齋發現了謀殺乾隆的證據。鄭曉燕、魏紫等人無法爭辯，所有的仆人立即被投入監獄。
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朱桓公主2多樣性第13集由於女王的煽動，王太後親自審問了設置巫術謀殺甘龍壹案。魏紫、燕子、金鎖等人在獄中膽戰心驚，但為了互相照顧，大家爭相認罪，而魏紫最後也想方設法保護燕子、金鎖等人的安全，於是在太後的嚴刑拷打下，勉強承認了這壹莫須有的滔天罪行。經過壹夜的理性分析，乾隆知道了所有的情節，但仍不及挽回魏紫的傷害。聰明的桑尼發現了用這種方法陷害罪魁禍首的人的破綻。這個令人震驚的發現也嚇壞了皇後和榮嬤嬤。
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珍珠公主2分集第14集魏紫是壹個受害者，但她在受到傷害後，仍然不忘想著加害者，懇求甘龍不要再追究陷害她的人。原本身體虛弱、體力不支的魏紫，在扛棍子打死的戲碼上演後，在大家的照顧下暈倒了。然而，神醫對魏紫的病情束手無策，爾康和乾隆都很難過。每個人都不相信魏紫有心情去愛，生命如此短暫以至於每個人都陷入絕望和悲傷。這時，費翔帶著她皇室的祖傳秘方來了，讓魏紫。
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珍珠公主2分集第15集經過項公主的急救，終於活了下來。在大家的精心護理下，魏紫也逐漸康復了。Sunny見證了爾康對魏紫的深愛，被深深的震撼和感動！於是晴兒向慈禧太後求情，希望慈禧太後能成全爾康和魏紫之間“驚天動地，泣鬼神”的愛情。聽完晴兒的話，慈禧太後陷入了更深的困惑。看不到香妃的蒙丹壹直在無休止地等待著。他很沮喪，但他剛剛經歷了蒙丹在爾康將要去哪裏的痛苦，所以他構思了壹個大計劃。
第16集，蒙丹在眾人的哄騙下，終於順利入宮，在寨與思念已久的韓翔相見。燕子等人在五壹宴會上退席，也引起了慈禧太後和皇太後的懷疑，於是大家都趕到方舒齋去看壹看。然而，慈禧太後和其他人看到幾個人戴著特殊的面具，他們在方舒齋。燕子、永琪等人見太後突然來訪，便以驅魔儀式為借口，捉弄惡容嬤嬤，把惡容嬤嬤嚇得魂不附體，奪門而逃。
回溯:/插曲/還珠格格250/3/
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還珠格格2多樣性入門第17集小燕子心情特別好。她玩煙火棒來慶祝。她拿著煙火棒，在屋頂上翻筋鬥。壹點點火花跳躍也引起了太後的註意。而且大家都玩得很開心，都在追逐火花。漱芳齋已經熱鬧非凡了。壹個不小心！然而，小燕子撞倒了前來找火的太後，慌亂中燒著了太後的背心，太後大怒！想把燕子和紫薇趕出皇宮。永琪為了扭轉太後的偏見，急於改造燕子，但是燕子和永琪發生了嚴重的沖突，最後燕子壹怒之下離家出走。
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朱桓公主2多樣性入門第18集小燕子私自出宮後，大家到處找不到，永琪後悔也來不及了。小燕子離開了皇宮，也就是說，她下定決心再也不回到皇宮，所以她也遠離了劉清兄妹的招待所。燕子壹時好奇，進了壹個棋社，然後在棋社裏和老板賭了壹把，最後在棋社裏結束了。永琪等人極力隱瞞燕子的失蹤，以此來搪塞乾隆皇帝的到訪。然而小燕子私自離宮的消息卻被缺德的榮母得知。她和皇後得意洋洋地給太後通風報信，太後現在又驚又怒！
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朱桓公主2多樣性介紹第19集小燕子離開皇宮後，皇宮裏就鬧翻了天！甘龍特福倫和額敏在城內和京外四處尋找。燕子被困在棋社，被老板娘百般虐待。燕子因為反抗吃了很多苦。她太餓了，甚至在夢裏，她都找不到食物。此時，燕子深深體會到永琪等人對她的重要性。有壹天，燕子終於逃出了棋社。這壹次，她不想爭強好勝，擔心自己的自尊心。她逃到客房，向劉清的哥哥姐姐和蒙丹尋求幫助。當他們得知燕子的遭遇時，他們感到震驚和憤怒！
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朱桓公主2多樣性介紹第20集雍琪知道了燕子在棋院所受的委屈，帶著蒙丹、爾康劉清等人到棋院為燕子報仇。小燕子回宮後，因為在外生活的艱辛和教訓，與永琪的誤會終於化解，而永琪和爾康也借機向太後表明，期待太後成全兩個戀人的心願。費翔和大家在方舒齋喝酒慶祝。然而，當她回到寶月大廈時，甘龍看到了費翔迷人的醉態，不禁勾起了甘龍征服費翔的欲望。為了保持自己的清白，費翔掏出匕首刺向甘龍！