2006年
4月20日19:00，百度百科測試版上線，上線數個小時內，詞條數目即增長到500余個。
2007年
1月10日，百科首頁第壹次改版。新增以下欄目：百科任務、每日圖片、歷史上的今天、百科之星、推薦詞條、待完善詞條、上周貢獻榜、總貢獻榜。 4月2日，百科蝌蚪團正式成立。 4月10日，百科蝌蚪團第壹批成員出現。 4月20日，詞條頁面改版。改良詞條頁面的行高和行寬，在詞條頁面的底部增加了漢英詞典解釋，改進歷史版本頁面。 7月27日，推出優質版本標準。 9月4日，百度百科詞條高級編輯器上線。增加所見即所得、段落標題、目錄瀏覽、特殊符號等功能。
2008年
1月16日，晚間10時許，詞條總量突破1,000,000。 第100萬詞條為“故事海”。 4月21日，百度百科正式版上線。首頁增加優質版本榜，優質詞條欄目；精彩詞條欄目升級。 8月28日，百科幫助頁更新，增加詞條編輯原則。 9月18日，詞條瀏覽頁升級。對瀏覽頁整體寬度做調整，規範正文內容的排版格式；調整詞條、開放分類、段落標題、編輯本段的顯示位置；增加基本信息統計，並通過“對我有幫助”評價功能代替原有的評論功能，從而把評論區入口隱藏；優化圖片顯示方式，增加圖片說明文字。 12月11日，詞條內容頁面添加免責說明。 12月22日，編輯器添加版本保存和編審系統提示，個人中心頁面調整。
2009年
2月5日，編輯器添加表格、二級標題和引用功能。 2月13日，個人中心升級，增加創建的詞條查看、修改版本查看、優質版本查看、瀏覽數等功能。 4月16日，夜間編輯提示上線，壹般情況下，從23:00至次日8:30將不再審核詞條。 6月4日，推出“高質量版本”認定稱號。 7月2日，百度百科首頁改版，增加熱點、熱門詞條榜、百科進行時、全新的百科之星等欄目。 8月10日，新版百度百科投訴中心啟用。 9月15日，百度百科積分系統正式從百度知道中分離，擁有單獨的壹套積分體系。 11月4日，百度百科分類頻道頁上線，將詞條分類存放，方便閱讀與管理。同日，“百度百科權威合作”項目建立。 11月26日，百科名片（新版詞條概述和基本信息欄）模塊上線。 12月21日，推出“圖片中間頁”，後更名“百科圖片頁”。
2010年
1月14 百科新版編輯器V1.0升級。 1月18日 百度百科登上百度首頁。 2月3日 百度百科分類管理員正式公布、標識上線。 2月8日 百度百科詞條總量突破200萬，第200萬個詞條是“章啟群”。 3月11日 百科個人信息模塊上線。 3月31日 百度百科啟用新版編輯器V2.0。 4月1日 百度百科參與愚人節惡搞活動，宣布推出新壹代“知·能”神瞳系統。 4月9日至11日 百度百科首次邀請33位用戶齊聚北京***慶百度百科四周年。 5月24日 新版百科個人中心發布。同時隨著是世界杯來臨舉辦了壹系列的活動，廣受好評。 6月11日 編輯提示功能上線。 7月1日 編輯器V3.0登場，在編輯時會實時生成目錄預覽，點擊目錄會跳到相應的段落，而光標停留在正文某段時， 左邊也會標識出所在的段落。在使用“編輯本段”功能時，還可以看到全局的目錄。 9月1日 百度百科詞條頁穿新衣。[1]
2011年
1月12日13時21分33秒，百度百科詞條總數突破了第三個百萬大關。用戶“slol ”在偶然的情況下，創建了名為“222年”的裏程碑式詞條，標記了中文互聯網的大百科時代。 3月11日 百度百科“關系”瀏覽方式正式增加並啟用。在百科關系裏，大家會看到壹個中心詞和其他壹切人以及事物之間千絲萬縷的關系。百科關系將詞條與詞條之間經緯交錯的關系展現在大家面前，將知識串聯在了壹起。我們從壹個中心詞出發，可以清晰的看到與它相關的各個詞，還能明確的知道它們之間都有怎樣的關系。從此以後，我們的詞條不再是孤軍奮戰，而是團結在壹起，為廣大的科友們提供更好的瀏覽體驗，讓每壹位科友都在百科中“瀏”連忘返。 4月1日 為了慶祝百度百科即將迎來五周年的生日，特舉行五周年嘉年華系列活動[2]。陸續推出各種活動。此次嘉年華活動是從4月1日開始，將壹直持續到五月中旬結束。