民國24年後，謝氏專心醫學著述和研究黃老之學。在上海中醫專門學校執教時所編教材為全國中醫學校采用。所著《中國醫學源流論》是其醫學思想之代表作，闡發中醫學術思想之演變與醫學變遷之關系，評價各家及流派，言簡意深，全面中肯，為近代醫史佳作。尚有《中國醫話》、《中國藥話》、《澄齋醫案》、《澄齋驗方》等書，收入《謝利恒先生全書》。
曾兩次任上海商務印書館編輯。主編《中國醫學大辭典》，歷時八載，全書350萬字，舉目7萬條，為近代中醫學巨著。民國11年(1922年)辭去商務印書館職，在上海設診行醫，治內、外、婦、兒諸科，於喉痧、疹痘及溫熱雜病尤所擅長。