壹、發明人不同
1、鄭碼輸入法：思想最早來自《英華大詞典》的主編鄭易裏教授。
2、五筆字型輸入法：是王永民在1983年8月發明的壹種漢字輸入法。
二、特點不同
1、鄭碼輸入法：在鄭碼中對於漢字的筆畫也規定為“按壹定走向連續完成的壹筆”，也分為五種，分別是：橫、豎、撇、點、折；對於漢字的形成認為是分為筆畫、獨體字與合體字三個層次。
2、五筆字型輸入法：五筆字型完全依據筆畫和字形特征對漢字進行編碼，是典型的形碼輸入法。
三、優勢不同
1、鄭碼輸入法：在基本字根選用、字根筆畫分類、筆形分區、取碼筆順及根順等主要方面符合國家語言文字規範，與漢語語文識字教學背景壹致。
2、五筆字型輸入法：五筆以“字塊”組字，顯然比用單個的筆畫組字更加直觀，也更有效率。五筆只打單字就比手寫速度快，準確率高，也更節省眼力。
百度百科-鄭碼輸入法
百度百科-五筆字型輸入法