（MWV編號為門德爾松作品專有編號） （壹）交響曲
1.管弦樂隊演奏的交響曲：
MWV.N.8 D大調交響曲（為弦樂隊而作的《D大調第八交響曲》的管弦樂隊版本，由門德爾松本人親自改編），完成於1822年；
MWV.N.13 c小調第壹交響曲（首演時稱c小調第十三交響曲），Op.11，完成於1824年；
MWV.A.18 降B大調第二（頌贊歌）交響曲（亦交響康塔塔），Op.52，完成於1840年；
MWV.N.18 a小調第三（蘇格蘭）交響曲，Op.56，完成於1842年；
MWV.N.16 A大調第四（意大利）交響曲，Op.90，完成於1833年；
MWV.N.15 d小調第五（宗教改革）交響曲，Op.107，完成於1830年，出版於1868年；
MWV.N.17 降B大調交響曲（未完成，僅存片段），寫於1839年；
MWV.N.19 C大調交響曲（未完成，僅存片段），寫於1845年。
2.弦樂隊演奏的交響曲（早期的作品，完成 於1821-1823年）：
MWV.N.1 C大調第壹交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.2 D大調第二交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.3 e小調第三交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.4 c小調第四交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.5 降B大調第五交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.6 降E大調第六交響曲，3個樂章，1821；
MWV.N.7 d小調第七交響曲，4個樂章，1821；
MWV.N.8 D大調第八交響曲，4個樂章，1822；
MWV.N.9 C大調第九交響曲，4個樂章，1823；
MWV.N.10 b小調第十交響曲，1個樂章，1823；
MWV.N.11 F大調第十壹交響曲，5個樂章，1823；
MWV.N.12 g小調第十二交響曲，3個樂章，1823；
MWV.N.14 c小調交響樂章，1個樂章，1823。
3.玩具交響曲（Kindersinfonie，全部遺失）
MWV.P.4 玩具交響曲，寫於1828年；
MWV.P.6 玩具交響曲，寫作時間不明；
MWV.P.8 玩具交響曲，寫作時間不明。
（二）序曲
MWV.P.3 E大調仲夏夜之夢序曲，Op.21（1826）；
MWV.P.1 C大調管樂序曲，Op.24（1824）；
MWV.P.7 b小調赫布裏底群島序曲，Op.26（1830，又名芬格爾洞序曲）；
MWV.P.5 D大調平靜的大海和幸福的航行序曲，Op.27（1828）；
MWV.P.12 F大調美麗的梅露西娜序曲，Op.32（1833）；
MWV.P.15 c小調呂伊·布拉斯序曲，Op.95（1839）；
MWV.P.2 C大調小號序曲，Op.101（1826）。
（三）其它管弦樂作品
MWV.P.14 a小調葬禮進行曲，Op.103（1836）；
MWV.P.16 D大調進行曲，Op.108（1841）；
MWV.P.17 降E大調進行曲，寫作時間不明；
MWV.P.18 降E大調進行曲，寫作時間不明。
（四）鋼琴協奏曲
MWV.O.2 a小調鋼琴協奏曲（壹架鋼琴與弦樂隊），完成於1822年；
MWV.O.5 E大調鋼琴協奏曲（兩架鋼琴與管弦樂隊），完成於1823年；
MWV.O.6 降A大調鋼琴協奏曲（兩架鋼琴與管弦樂隊），完成於1824年；
以下為壹架鋼琴與管弦樂隊的協奏曲：
MWV.O.7 g小調第壹鋼琴協奏曲，Op.25，完成於1831年；
MWV.O.11 d小調第二鋼琴協奏曲，Op.40，完成於1837年；
MWV.O.13 e小調第三鋼琴協奏曲，寫於1842至1844年；
註：門德爾松本人並未完成e小調第三鋼琴協奏曲，它有部分管弦樂譜（其中只有第壹樂章的前11小節是完整的，此外還有56小節不完整的管弦樂譜）和鋼琴譜草稿，並未由作曲家本人親自配器完成。第壹、二樂章（分別為e小調、a小調）的鋼琴譜草稿由門德爾松本人完成，第三樂章（E大調）的鋼琴譜草稿未完成，僅有20小節。由意大利鋼琴家普羅希達（Roberto Prosseda）於2006年在牛津的圖書館中發現這兩份手稿，並求助於研究門德爾松作品的權威學者布法裏尼，將之補寫完成，並於2007年進行全球首演，後又與指揮大師裏卡多·夏伊（Ricardo Chailly）和萊比錫布商大廈管弦樂團合作錄制了壹張唱片。
（五）小提琴協奏曲：
MWV.O.3 d小調小提琴協奏曲（壹把小提琴與弦樂隊），完成於1822年；
MWV.O.14 e小調小提琴協奏曲（壹把小提琴與管弦樂隊），Op.64，完成於1844年；
（六）二重協奏曲：
MWV.O.4 d小調鋼琴與小提琴協奏曲（鋼琴、小提琴與弦樂隊），完成於1823年。
（七）大提琴協奏曲：門德爾松曾於1844年之後寫過壹首大提琴協奏曲，不過此曲手稿後來遺失。
（八）鋼琴與樂隊作品（協奏曲除外）：
MWV.O.1 d小調宣敘調曲（鋼琴與弦樂隊），完成於1820年；
MWV.O.8 b小調輝煌隨想曲，Op.22，完成於1832年；
MWV.O.9 c小調輝煌變奏曲（Duo concertant en variations brillantes，兩架鋼琴與樂隊），Woo.25，完成於1833年。
MWV.O.10 降E大調輝煌回旋曲，Op.29，完成於1834年；
MWV.O.12 b小調小夜曲與歡快的快板，Op.43，完成於1838年。 1.合唱作品：
清唱劇有：《聖保羅》（1834-1836）、《以利亞》（1846-1847）、《耶穌基督》（未完成，1847）；
交響康塔塔《頌贊歌》（1840，有人稱之為第二交響曲）；九首詩篇歌；九首經文歌。
2.戲劇音樂：
歌劇有：《卡馬秋的婚禮》（1825）、《兒子與陌路人》（1829）、《洛雷利》（未完成，1847）；戲劇配樂有《安提戈涅》 (1841）、《第壹個瓦爾普吉斯之夜》（1831,1842）、《仲夏夜之夢》（1843）、《阿塔利亞》（1843-1845）、《俄狄浦斯在科洛納斯》（1845）。
3.室內樂：
六首弦樂四重奏；三首鋼琴四重奏（1822-1825）；兩首弦樂五重奏（1831,1845）；弦樂六重奏（1824）；弦樂八重奏 (1825）；兩首三重奏（d小調，1839；c小調，1845）；小提琴奏鳴曲，兩首大提琴奏鳴曲（1838、1843）。
4.鋼琴：《升f小調隨想曲》（1825）；《e小調回旋隨想曲》；六首前奏與賦格（1832-1837）；六集《無詞歌》。
5.管風琴：三首前奏曲與賦格（1833-1837）；六首奏鳴曲（1839-1844)。
6.歌曲與主調合唱曲：十套鋼琴伴奏的歌曲；十壹套主調合唱曲。