著有《河》(詩集)、《父親和他的黑布襖》(詩集)、《雷鋒叔叔》(兒童傳記文學)、《“咕咚”來了》(詩集)、《松樹姑娘》(詩集)、《雲嶺短笛》(詩集)、《忘了大海的海豹》(寓言集)、《馬瑞麟童話寓言詩選》《山戀》(長詩)、《孔雀與森林》(歌曲集·詞)、《詩的星空》(詩集)、《看雲集》(散文集)、《搖籃》(寓言選集·漢阿對照)、《詩的沈思》(詩論集)、《雲雀集》(微型詩集)、《清真指南譯註》(古籍譯註)、《童心流出的愛泉》(主編報告文學集)、《我輕輕地吹起蘆笛》（詩集）、《野花》（散文詩集）、《看雲樓隨筆》（散文隨筆集）、《馬瑞麟詩選》。寓言散文詩《小穿山甲打洞》、《蠢鴨子》、《小燕壘窩》獲雲南省兒童文學創作獎，小說《可可與海鷗》獲《春城兒童故事報》紀念建黨七十周年獻禮征文特別獎、昆明市文聯新時期十年文學貢獻獎，《馬瑞麟詩選》獲雲南昆明茶花獎。長詩《咕咚來了》1980年獲雲南省及全國首屆少數民族文學創作獎；1983年《小穿山甲打洞》、《蠢鴨子》、《小燕壘窩》三章寓言散文詩獲雲南省兒童文學創作獎；1991年小說《可可與海鷗》獲《春城兒童故事報》建黨70周年獻禮征文特別獎；同年獲昆明市文聯新時期十年文學貢獻獎。
作品入選全國近百種詩選、散文選與散文詩選。北京、新疆、寧夏、四川、甘肅、河南、雲南等地報刊，曾先後發表過對他的作品的專訪專論百余篇。寧夏人民出版社還在此基礎上出版了由李樹江、賈羽主編的《馬瑞麟劇作研究》。雲南人民廣播電臺與中國國際廣播電臺，曾分別用漢語與阿拉伯語以《詩情恰似滇池水，雲雀歌聲繞賀蘭》及《笛聲悠揚頌祖國》為題，向國內外聽眾介紹過他和他的作品。《中國文學家辭典》、《中國作家大辭典》、《中國現代文學辭典·詩歌者》、《中國詩歌大辭典》、《中國新詩大辭典》、《世界華人文學藝術名人錄》、《世界名人錄·中國卷》等24種辭書，《中國當代少數民族文學史稿》、《當代回族文學史》等史書及《雲南省誌·文學誌》等誌書，收有他的辭條、小傳及對他和他的作品的評述。現為中國作家協會會員、中國少數民族作家學會理事、雲南作家協會會員。